Từng có quá khứ không mấy êm ấm với nhau khi còn ở Chelsea nhưng trong buổi trả lời phỏng vấn gần nhất, Mourinho khẳng định chẳng có vấn đề gì với Juan Mata hết:
"Khi tôi đến, ai cũng nghĩ Mata sẽ gặp phải rắc rối. Nhưng lúc ấy tôi biết sẽ không có chuyện đó, thứ bóng đá Chelsea chơi khác với lối đá tôi muốn tạo dựng cho Man United.
Ngay từ đầu tôi đã xác định Mata là một cầu thủ quan trọng với Man United và đáp ứng được triết lí tôi muốn xây dựng. Cậu ấy rất tự tin trong việc thể hiện bản thân và rất hạnh phúc cả trong lẫn ngoài sân cỏ. Bạn có thể thấy điều đó qua cách chơi bóng của Mata".
Juan Mata và Mourinho không hề có bất cứ vấn đề gì tại Man United.
Mùa Hè năm 2016, sau khi có thông tin Người đặc biệt ngồi lên ghế nóng tại Old Trafford, đã có nhiều lời đồn thổi và lo ngại cho tương lai của Juan Mata. Thậm chí một vài nguồn tin còn cho rằng anh sẽ sớm phải rời Man United.
Tuy nhiên, khác hẳn với 2 năm trước, Mata làm việc rất ăn ý với Mourinho. Chỉ tính riêng tại Premier League, tiền vệ người TBN đã ghi được 6 bàn thắng, xếp thứ hai sau Ibrahimovic. Ngoài ra anh còn đóng góp rất tích cực vào lối nhờ kỹ thuật cũng như nhãn quan sắc bén của mình.
Clip Man United 2-0 Watford: