Theo tạp chí quân sự Janes, Brazil ban đầu dự định hoàn thành chương trình nâng cấp máy bay A-4BR Skyhawk vào tháng 9-2014, nhưng mốc nói trên hiện đã lùi lại tới tháng 11-2017.
Việc kéo dài chương trình nâng cấp cũng lùi thời điểm chiếc AF-1B (phiên bản nâng cấp) đầu tiên được chuyển giao cho Hải quân Brazil sang đầu năm 2015.
Lý do chính của việc kéo dài chương trình nâng cấp máy bay AF-1A là do Bộ Quốc phòng Brazil không tìm đủ nguồn tài chính cần thiết. Ngoài ra, việc kéo dài chương trình nâng cấp được hy vọng sẽ giúp giảm giá thành hợp đồng từ 50 tới hơn 100 triệu USD.
Hiện tại, công ty chế tạo hàng không Brazil Embraer đang chịu trách nhiệm nâng cấp máy bay AF-1A.
Theo thoả thuận ký từ tháng 4-2009, Embraer nâng cấp 12 chiếc AF-1A, gồm 9 máy bay phiên bản 1 chỗ ngồi và 3 máy bay phiên bản 2 chỗ ngồi. Sau gói nâng cấp, các đơn vị AF-1B sẽ tiếp tục phục vụ Hải quân Brazil ít nhất tới năm 2025.
Trong gói nâng cấp, Embraer sẽ gia cố khung sườn máy bay, lắp đặt hệ thống điện tử trên khoang, ra-đa hàng không đa khẩu độ, thiết bị tái tạo dưỡng khí trên khoang và nhiều trang bị nâng cấp tương ứng.