Công ty đóng tàu Navantia của Tây Ban Nha cho biết con tàu đã gặp phải rất nhiều vấn đề liên quan tới sự phân bổ trọng lượng lên toàn bộ thân tàu. Theo ước tính sơ bộ, quá trình khắc phục lỗi thiết kế này sẽ mất tới 2 năm.
Con tàu mang tên Isaac Peral, là chiếc tàu ngầm đầu tiên thuộc dự án tàu ngầm Project S-80 mà Bộ Quốc phòng Tây Ban Nha đặt hàng năm 2009, với trị giá hợp đồng là 2,2 tỷ euro. Loại tàu ngầm này được mệnh danh là "tàu ngầm hiện đại nhất thế giới".
Các kỹ sư của doanh nghiệp thi công là Navantia sau khi tính toán đã phát hiện thiết kế của Isaac Peral đã tạo ra siêu trọng, sau khi hạ thủy thì sẽ chìm thẳng xuống dưới đáy biển và không thể nổi lên.
Các chi tiết khác về lỗi kỹ thuật của con tàu trong quá trình thiết kế không được tiết lộ. Hiện nay, có 2 phương án để khắc phục vấn đề là giảm trọng lượng hoặc tăng chiều dài thân tàu. Công ty Navantia cho biết họ có thể tăng chiều dài của Isaac Peral. Phương án này có vẻ khả thi hơn nhưng cũng rất đắt đỏ, cứ tăng thêm 1 m thân tàu ngầm là chi phí chế tạo sẽ tăng lên 7,5 triệu euro.
Sắp tới, công ty Navantia có thể sẽ phải nhờ tới sự tư vấn của các chuyên gia nước ngoài. Việc trì hoãn tiến độ bàn giao các con tàu mới sẽ buộc Bộ Quốc phòng Tây Ban Nha xem xét lại quỹ chi tiêu quốc phòng mà nước này đã phải cắt giảm 30% do ảnh hưởng của khủng hoảng kinh tế và tài chính toàn cầu trong mùa thu năm 2008. Số tiền này không chỉ cần thiết để khắc phục các lỗi thiết kế của tàu Project S-80 mà còn giúp Tây Ban Nha duy trì hệ thống kỹ thuật của những con tàu đang hoạt động. Theo ước tính sơ bộ, việc bảo dưỡng các con tàu đang hoạt động sẽ được tiến hành trong giai đoạn 2015-2016, với chi phí 15 triệu euro mỗi năm.
Theo kế hoạch, tàu Isaac Peral sẽ được hạ thủy vào năm 2015 nhưng giờ thì con tàu sẽ không thể đi vào hoạt động trước năm 2017. Không rõ điều này có ảnh hưởng tới tiến độ bàn giao chiếc tàu thứ 2 thuộc Project S-80 hay không bởi theo dự kiến thì nó sẽ được bàn giao cho Hải quân Tây Ban Nha vào năm 2016.
Tàu Isaac Peral có độ dài 71,05 m, chiều rộng 11, 68 m, được trang bị hệ thống lực đẩy không phụ thuộc không khí vào có thể đạt tốc độ lên tới 19 knot (35km/h) khi lặn. Isaac Peral được trang bị 6 ống phóng ngư lôi 533 mm và tên lửa hành trình chống tàu.