Một trong những bí mật của Không quân Mỹ phải kể đến chương trình huấn luyện phi công mà chúng ta biết đến với cái tên "Top Gun" (tên của một bộ phim được công chiếu vào năm 1986).
Chương trình huấn luyện phi công bí mật cho lực lượng Không quân Mỹ tạo ra những "phi công siêu đẳng" là để đáp lại một thực tế là trong thời kỳ chiến tranh lạnh vũ khí của Liên Xô đặc biệt là Không quân được trang bị cực kỳ tốt.
Những máy bay của Liên Xô hoàn toàn có thể tấn công nước Mỹ bất cứ khi nào họ cần.
Để tạo ra lực lượng phòng thủ các chuyên gia quân sự Mỹ tạo nên kế hoạch "phòng thủ sâu" theo lý thuyết những máy bay Mỹ phải 1 đánh 1 với máy bay Liên Xô theo kiểu cận chiến.
"Dogfight" là cái tên mà người ta thường nhớ về kiểu không chiến đặc biệt khi mà các máy bay rượt đuổi nhau và trao đổi hàng loạt đạn từ khẩu súng máy từ vị trí ngay sát sau lưng máy bay đối phương.
Nguyên tắc đầu tiên trong một cuộc không chiến là bạn phải nhìn thấy đối thủ của bạn. Người ta đã nhắc đi nhắc lại các phi công rằng "bạn không thể bắn thứ mà bạn không thấy".
Tất nhiên điều đó sẽ khó khăn hơn nếu ở trong vào một cuộc chiến có nhiều máy bay tham gia.
Tuy nhiên với thêm một sĩ quan quan sát radar và các thông số của máy bay ngồi ở ghế sau của F-14 thì chuyện khó khăn khi không chiến với nhiều máy bay đã không còn. Phi công có thể rảnh tay lái còn mọi chuyện còn lại đã có người đồng đội phía sau lo.
Để mô phỏng một cuộc chiến trên không có thể xảy ra với Liên Xô, Mỹ đã đưa vào thực hiện các chương trình huấn luyện bí mật để thực tập những trận "dogfight" có thể có ngoài thực tế.
Ban đầu Mỹ sử dụng máy bay A-4 để giả làm MiG-21 và máy bay F-5 để giả làm MiG-23. Tuy nhiên chỉ giống thôi là chưa đủ vì thực tế máy bay Mỹ và Nga có những chức năng hoàn toàn khác nhau.
Thông tin vui cho chương trình "Top gun" của Mỹ là vào thập niên 80, Không quân Mỹ có được vài chiếc máy bay Liên Xô mà Israel chiếm được từ Syria.
Sau đó Mỹ còn mua được một vài máy bay Liên Xô từ Pakistan và Trung Quốc. Điều đó khiến cho Mỹ có kha khá máy bay Liên Xô để nghiên cứu chiến thuật.
Thế là kế hoạch luyện tập bí mật để tạo ra phương pháp tiếp cận tốt nhất cho một cuộc không chiến với máy bay Liên Xô được bắt đầu.
Cuộc diễn tập bí mật được thực hiện ở sân bay "The Red Eagles" (đại bàng đỏ) nằm sâu trong hoang mạc Nevada nơi mà đến những phi công được dùng để thực tập chương trình "top gun" cũng chưa từng nghe tới tên trước khi tham gia chương trình.
Sau vài năm thực hiện chương trình thì phi công Mỹ đã hoàn thành các phương pháp áp chế máy bay Liên Xô trong khả năng không chiến tầm gần.
Tuy nhiên thực sự cuối cùng mọi sự chuẩn bị của Mỹ đều trở nên dư thừa khi Liên Xô sụp đổ và sẽ không có trận không chiến nào trên bầu trời giữa hai bên như giả định nữa.
Một trong những bí mật khác của Quân đội Mỹ là việc họ phát triển máy bay tàng hình F-117 trong những năm 1970 mà đã được công khai vào đầu thập niên 90 của thế kỷ 20 khi mà F-117 bắt đầu tham chiến.
Ai mà biết được Không quân Mỹ còn những bí mật nào sau cánh cổng của những căn cứ quân sự bí mật của họ.