Nội dung kết luận điều tra cho biết, khoảng cuối tháng 7-2014, Phòng PC45 CATP Hà Nội nhận được đơn tố giác của anh Nguyễn Thành Long, SN 1975, trú tại quận Đống Đa đề nghị CQĐT làm rõ nghi ngờ về việc chùa Bồ Đề đã đem bán cháu Cù Nguyên Công là con đỡ đầu của anh Long.
Qua điều tra, khoảng giữa năm 2011, chị Trần Thu Hà, SN 1989, quê ở Cẩm Khê, tỉnh Phú Thọ, chung sống như vợ chồng với anh Vũ Xuân Trường, SN 1984, trú tại huyện Yên Sơn, tỉnh Tuyên Quang và có thai.
Chị Hà đã sinh một cháu trai tại một nhà nghỉ trên địa bàn quận Nam Từ Liêm, sau đó mang đến chùa Bồ Đề nhờ nuôi dưỡng.
Chị Hà đã gặp nhà sư Thích Đàm Lan, nói dối là con của một người khác nên sư Thích Đàm Lan đã hướng dẫn chị này đến gặp Nguyễn Thị Thanh Trang là người quản lý khu nhà trông trẻ, đồng thời là người giúp việc cho sư Thích Đàm Lan để làm thủ tục tiếp nhận cháu bé.
Trong thời gian này, anh Nguyễn Thành Long có đến chùa Bồ Đề làm từ thiện, đã gặp và muốn nhận cháu Cù Nguyên Công làm con đỡ đầu đặt tên là Lãi.
Một thời gian sau đó, anh Long nhận được tin bố mẹ đẻ của cháu Công đã nhận đón cháu về nuôi, tuy nhiên thông tin mù mờ và không rõ ràng.
Ngay sau khi nhận được thông tin, lực lượng CA làm rõ, đối tượng Phạm Thị Nguyệt, SN 1970, trú tại xã Khánh Hòa, huyện Yên Khánh, tỉnh Ninh Bình là đối tượng có nhân thân phức tạp, sống như vợ chồng với anh Phạm Văn Hữu, làm nghề lái xe tắc-xi và anh Nguyễn Văn Vũ, SN 1979.
Trước khi mua cháu Cù Nguyên Công, vì có thời gian sống xa nhau nên Nguyệt đã nói dối anh Hữu mang thai một bé trai, sinh ra đặt tên là Phạm Đức Anh (thực chất, Nguyệt xin nơi khác về nuôi).
Sau đó, Nguyệt tiếp tục nói dối anh Hữu mang thai đôi, rồi sinh hai cháu Phạm Gia Hân và Phạm Gia Bảo (Cù Nguyên Công). Anh Hữu vẫn tin cả ba cháu bé là con của mình nên mỗi tháng vẫn gửi từ 3-7 triệu đồng cho Nguyệt để nuôi con.
Tuy nhiên thời gian sau này, Nguyệt chuyển đến sống cùng anh Vũ và nuôi thêm cháu Phạm Việt Anh.
Trong những lần đi lễ tại chùa Bồ Đề, Nguyệt gặp Nguyễn Thị Thanh Trang, Trang cho Nguyệt biết hiện đang có 1 bé trai khỏe mạnh bị cha mẹ bỏ rơi, nếu Nguyệt muốn nhận về thì phải đưa 40 triệu đồng để trả cho mẹ đẻ của cháu.
Nguyệt sau đó nhờ chị Nguyễn Thị Lương Giang, SN 1973, trú tại phường Khương Đình, quận Thanh Xuân vờ nhận làm con nuôi, sau đó gọi điện cho anh Vũ nói dối là con bị ốm để vay số tiền 40 triệu đồng trả cho Trang.
Nguyệt đã trả 35 triệu đồng cho Trang để nhận được cháu Cù Nguyên Công, tuy nhiên Trang chỉ đưa cho Hà, mẹ đẻ cháu Công 10 triệu đồng bồi dưỡng còn 25 triệu đồng giữ lại chi tiêu.
Trong quá trình nuôi dưỡng, cháu Công bị bệnh sởi và Nguyệt đưa cháu đến BV Nhi TW điều trị.
Để được giảm viện phí, Nguyệt biết thông tin các cháu dưới 6 tháng tuổi nếu có đầy đủ giấy tờ sẽ được giảm viện phí nên đã thông qua một người chị họ là Phạm Thị Gương, nguyên y tá tại Trạm y tế xã Kim Hải, huyện Kim Sơn, tỉnh Ninh Bình để làm giả giấy chứng sinh cho cháu Công, lấy tên Phạm Gia Bảo rồi làm thủ tục đăng kí kết hôn với anh Phạm Văn Hữu.
Tuy nhiên, do bệnh nặng, cháu Công đã tử vong tại BV.
Quá trình điều tra, CQĐT đã tiến hành khai quật mộ cháu bé Cù Nguyên Công lấy mẫu vật để giám định gen với bố mẹ đẻ của cháu là chị Hà và anh Trường.
Kết quả giám định cháu Cù Nguyên Công đã chết, được an táng tại nghĩa trang xã Phú Túc, huyện Phú Xuyên, nơi gia đình anh Phạm Văn Hữu sinh sống.
Quá trình điều tra còn xác định, ngoài việc mua cháu Cù Nguyên Công, trước đó Nguyệt còn nhận nuôi hai cháu trai khác, thông qua một nhân viên làm việc tại khoa sản – nhi của BV Sản-nhi tỉnh Ninh Bình tên là Lê Thị Tú Anh, SN 1976 để lấy giấy chứng sinh cho hai cháu bé này để rồi mang giấy tờ khống này đi làm khai sinh cho hai cháu bé mang họ Phạm tại UBND phường Ninh Sơn, TP Ninh Bình.
Về phía các anh Phạm Văn Hữu và Nguyễn Văn Vũ là những người đã cung cấp tiền bạc để nuôi 4 cháu nhỏ, anh Hữu đề nghị Nguyệt bồi thường số tiền 201 triệu đồng, anh Vũ đề nghị bồi thường 40 triệu đồng.
Lê Thị Tú Anh và Phạm Thị Gương là những người đã giúp Nguyệt làm giấy chứng sinh khống cho 4 cháu bé được Nguyệt nuôi, ông Phan Quốc Viện, nguyên Trạm trưởng Trạm y tế xã Kim Hải, ông Cao Văn Khải, Trạm trưởng Trạm y tế xã Kim Hải và ông Phạm Văn Dậu, Phó GĐ BV Sản-nhi tỉnh Ninh Bình là những người đã kí tên đóng dấu vào các giấy chứng sinh đều không thỏa thuận hay thống nhất gì với Nguyệt trong việc cấp giấy chứng sinh, không hưởng lợi gì từ việc này nên không đủ cơ sở kết luận có hành vi đồng phạm với Nguyệt.
Tất cả các cá nhân này đều bị đề nghị xử phạt hành chính.
