Ngày 8-3-2013, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an TP Cần Thơ đã khởi tố bị can và bắt tạm giam đối với Huỳnh Thiện Quân (SN 1966, ngụ khu vực 11, phường Hưng Phú, quận Cái Răng) về hành vi giết người.
Khoảng 21 giờ ngày 16-2-2013, sau khi nhậu xong, Huỳnh Thiện Quân chở Nguyễn Thanh Tần về vườn lan tại khu vực 2, phường Hưng Thạnh, quận Cái Răng (Tần trông coi vườn lan cho anh Hồ Đắc Thành Nhân, hàng ngày Tần ngủ tại nhà kho ở vườn lan), rồi điều khiển xe về nhà anh Huỳnh Thiện Vũ (ngụ tại phường Hưng Phú, quận Cái Răng) để cất xe. Sau đó, Quân đón xe ôm đến nhà anh Huỳnh Thiện Tuấn (ở khu vực 11, phường Hưng Phú, quận Cái Răng). Quân vào nhà cất đồ rồi đi bộ quay trở lại vườn lan để quan hệ tình dục với Tần (Quân và Tần có mối quan hệ đồng tính nam).
Trong quá trình nói chuyện, giữa Quân và Tần xảy ra cự cãi. Quân bỏ về phòng trọ của Tần (ở khu vực 2, phường Hưng Thạnh), còn Tần vào nhà kho nằm ngủ nhưng không đóng cửa. Do Tần từ chối, cắt đứt quan hệ nên Quân nảy sinh ý định giết Tần, sau đó tự tử.
Quân lấy con dao Thái Lan và chai axit trong phòng rồi quay trở lại vườn lan. Quân pha axit và bỏ vào một ca nhựa, đi vào nhà kho thì thấy Tần đang nằm ngủ. Bất ngờ lúc này Tần ngồi dậy, Quân cầm ca axit tạt vào người Tần. Tần chống cự lại thì bị Quân cầm dao đâm liên tục vào người Tần, làm nạn nhân tử vong.
Sau đó, Quân ôm Tần đặt lên giường rồi đi ra trước nhà kho ném bỏ con dao. Xong xuôi, Quân vào nhà kho lấy hai chai thuốc sâu uống tự tử và nằm ôm Tần chờ chết.
Khoảng 6 giờ 30 phút, ngày 17-2-2013, anh Nhân đến vườn lan để làm. Thấy cửa nhà kho bị khóa từ bên trong nên anh Nhân dùng chìa khóa mở cửa ra kêu Tần thức dậy nhưng không thấy Tần trả lời. Anh Nhân đến gần thì phát hiện Tần đã chết còn Quân đang nằm thở thoi thóp. Anh Nhân liền báo sự việc cho lực lượng bảo vệ của Công ty xây dựng số 8 và đưa Quân đi cấp cứu. Hiện sức khỏe Quân đã bình phục.