Bệnh tay chân miệng có những biểu hiện gần giống với nhiều bệnh khác như zona, thủy đậu, mụn nước... nên khiến cho các bậc cha mẹ nhầm lẫn. Điều này dẫn tới việc chậm trễ hoặc sai lầm trong chữa trị khiến bệnh tiến triển nhanh hơn và khó kiểm soát khi bị nặng.
Hiện các bác sĩ thực hiện phân loại bệnh tay chân miệng ở trẻ em theo mức độ nặng của bệnh theo 4 mức độ để xác định và đưa ra quyết định bệnh nhân nhi có cần nhập viện điều trị hay không.
Theo đó, nếu bệnh nhân ở mức độ 1 có các dấu hiệu ở da, niêm mạc bao gồm phỏng nước lòng bàn tay, bàn chân hay ở các nếp gấp như khuỷu tay, đầu gối, mông, kèm theo nốt ở miệng thì bệnh nhi có thể điều trị tại nhà.