Năm 2014, Zidane giữ chức trợ lý của HLV Ancelotti, sau nhiều năm phụ trách công tác đào tạo trẻ ở Real. Đây được xem là công việc giúp ích rất nhiều cho Zidane trong hành trình làm HLV sau này. Cùng với Zidane, HLV Ancelotti đã giúp Real giành chức vô địch Champions League vào năm 2014.
Năm 2016, khi Rafa Benitez cùng Real tạo ra thành tích bết bát, Zidane được bổ nhiệm vào ghế HLV trưởng, mở ra thời kỳ huy hoàng cho đội bóng Hoàng gia.
Chưa có kinh nghiệm dẫn dắt bất cứ đội bóng nào nhưng Zidane đã giúp Real giành chức vô địch Champions League ngay năm 2016.
Thành công của Zidane không dừng lại ở đó. Trong 9 trận chung kết ông dẫn dắt, Real đều giành chức vô địch. Từ Champions League, Siêu Cúp châu Âu, Cúp thế giới các CLB...
Chỉ trong hơn 2 mùa dẫn dắt Real, Zidane đã gặt hái gần 10 danh hiệu lớn, điều mà có thể những HLV hàng đầu khác không thể làm được trong cả sự nghiệp.
Vốn là một cầu thủ tài năng, lại gần gũi với các cầu thủ, Zidane đã tạo ra không khí thoải mái trong phòng thay đồ, điều quan trọng tạo ra một Real Madrid đoàn kết.
Zidane trong ngày vô địch La Liga mùa 2016/17.
Và trong khoảnh khắc giành chức vô địch Champions League mùa thứ 2 liên tiếp.
Zidane cùng cầu thủ Real đánh bại Man Utd, đăng quang Siêu Cúp châu Âu.
Cái uy của Zidane lớn đến nỗi một siêu sao vốn có cái tôi lớn như Cristiano Ronaldo cũng phải nghe lời. Mùa giải qua, Zidane liên tục cho Ronaldo nghỉ ngơi, không thi đấu thường xuyên và Ronaldo vui vẻ chấp hành, điều rất khác so với Benitez trước đây.
Zidane ôm Ronaldo sau chiến thắng ở Cúp thế giới các CLB.
Với những thành công to lớn, không có gì ngạc nhiên khi nhà cầm quân người Pháp đoạt danh hiệu HLV xuất sắc nhất thế giới.
Và đây là khoảnh khắc ăn mừng cuối cùng của Zidane cùng các cầu thủ Real Madrid. Mùa 2017/18, Real giành chức vô địch Champions League thứ 3 liên tiếp. Trên đỉnh vinh quang, Zidane đã ra đi.