Các dự án đường sắt đô thị, như tuyến số 1 Thành phố Hồ Chí Minh, tuyến Bến Thành - Suối Tiên, dự án Đường sắt đô thị Hà Nội, tuyến Cát Linh - Hà Đông; dự án Cải tạo, nâng cấp tuyến đường sắt Yên Viên - Lào Cai; dự án Nâng cao an toàn cầu đường sắt trên tuyến Hà Nội - TP. Hồ Chí Minh cũng nằm trong diện kiểm toán năm tới.
Cùng với đó, KTNN sẽ thực hiện kiểm toán với nhiều dự án đầu tư theo hình thức BOT, điển hình như dự án đầu tư xây dựng công trình cầu Việt Trì - Ba Vì nối Quốc lộ 32 với Quốc lộ 32C theo hình thức hợp đồng BOT; dự án đầu tư xây dựng công trình đường cao tốc Trung Lương - Mỹ Thuận giai đoạn 1 theo hình thức hợp đồng BOT; dự án cải tạo, nâng cấp Quốc lộ 18 đoạn Bắc Ninh - Uông Bí theo hình thức hợp đồng BOT; dự án đầu tư xây dựng hầm đường bộ qua đèo Cả - Quốc lộ 1, tỉnh Phú Yên và tỉnh Khánh Hòa theo hình thức BOT và BT…
Ngoài ra, KTNN sẽ tập trung kiểm toán hoạt động tái cơ cấu thị trường tài chính, trọng tâm là ngân hàng thương mại và các tổ chức tín dụng.
Đồng thời kiểm toán việc cơ cấu lại ngân sách Nhà nước, khu vực công theo Nghị quyết số 07-NQ/TW ngày 18/11/2016 của Bộ Chính trị về chủ trương, giải pháp cơ cấu lại ngân sách Nhà nước, quản lý nợ công để bảo đảm nền tài chính quốc gia an toàn, bền vững và Nghị quyết số 24/2016/QH14 ngày 08/11/2016 của Quốc hội về kế hoạch cơ cấu lại nền kinh tế giai đoạn 2016-2020.
Bên cạnh đó, sẽ tập trung kiểm toán các chính sách ưu đãi đầu tư tại các khu kinh tế, nhằm đánh giá hiệu quả các chính sách ưu đãi của Chính phủ và các địa phương đối với các doanh nghiệp đầu tư hoạt động trong các khu kinh tế.
Đối với lĩnh vực kiểm toán hoạt động: Để từng bước phát triển loại hình kiểm toán hoạt động theo Chiến lược phát triển KTNN đến 2020, KTNN tiếp tục mở rộng quy mô và số lượng các cuộc kiểm toán hoạt động.