Theo cáo trạng, Phúc và Nguyễn Lương Trúc Đ (hơn 12 tuổi) cùng trú tại xã Ninh Xuân, huyện Ninh Hòa (Khánh Hòa) là hàng xóm của nhau.
Vào đầu tháng 1/2016, Phúc dùng điện thoại di động gọi điện thoại và nhắn tin đến số điện thoại di động của Đ để dụ dỗ và làm quen.
Trong thời gian này, Phúc đi đến khu vực chợ Ninh Hòa, vào một tiệm thuốc tây mua 4 viên thuốc ngừa thai 24 giờ. Khoảng 23h ngày 6/2/2016, Đ dùng điện thoại nhắn tin và rủ Phúc sang nhà Đ chơi.
Phúc đi bộ qua nhà của Đ và đến trước phòng ngủ của Đ gõ cửa thì Đ mở cửa để Phúc vào phòng rồi cả hai cùng làm "chuyện người lớn".
Sau đó, Phúc đưa cho Đ 1 viên thuốc tránh thai đã chuẩn bị trước để cho Đ uống và ngủ tại phòng của Đ đến sáng ngày 7/2/2016 thì Phúc đi về nhà.
Đến ngày 17/2/2016, Đ bỏ nhà qua nhà Phúc ở, trước khi đi Đ để lại bức "thư tình" của Phúc thể hiện tình yêu đối với Đ. Gia đình Đ phát hiện bức thư và sang nhà Phúc để tìm nhưng không gặp.
Đến rạng sáng 18/2/2016, bà Nguyễn Thị Huệ là mẹ ruột của Phúc gặp Đ và bảo Đ đi về nhà. Sau khi về đến nhà, Đ đã kể cho gia đình nghe toàn bộ sự việc.
Cùng ngày, gia đình của Đ đã đưa Đ đến Công an TX Ninh Hòa tố giác hành vi hiếp dâm trẻ em của Phúc. Tại Công an TX Ninh Hòa, Phúc đã khai nhận toàn bộ hành vi phạm tội như trên.
Ngoài ra, Phúc còn khai nhận, trước đó trong khoảng thời gian từ tháng 1 đến tháng 2/2016, Phúc đã 3 lần qua nhà Đ và thực hiện hành vi giao cấu với Đ tại phòng ngủ, sau mỗi lần giao cấu Phúc đều cho Đ uống thuốc tránh thai.